USB 3.1 spetsifikatsioon on jagatud kaheks versiooniks: USB 3.1 Gen 1 (USB 3.0) ja USB 3.1 Gen 2. Siin on nende peamised erinevused.
1. Andmeedastuskiirus:
- USB 3.1 Gen 1 edastuskiirus on 5 Gbps ehk 500 MB/s.
- USB 3.1 Gen 2 edastuskiirus on 10 Gbps ehk 1250 MB/s.
2. Toiteedastusvõime:
- USB 3.1 Gen 1 maksimaalne toiteallikas on 5 V/0,9 A (4,5 W).
- USB 3.1 Gen 2 maksimaalne toiteallikas on 20V/5A (100W).
3. Liidese kuju:
- USB 3.1 Gen 1 liidese kuju on sama, mis USB 2.0, kuvatakse tavaliselt ruudukujulise tihvtina.
- USB 3.1 Gen 2 liidese kuju on sama, mis USB 3.0, kuvatakse tavaliselt lameda tagurpidi konksnõelana.
4. Ühilduvus:
- USB 3.1 Gen 1 ühildub täielikult USB 2.{5}} seadmetega.
- USB 3.1 Gen 2 ühildub nii USB 2.0 kui ka USB 3.0 seadmetega, kuid edastuskiirust piirab kõige aeglasem seade.
Lühidalt öeldes pakub USB 3.1 Gen 2 suuremat andmeedastuskiirust ja suuremaid toiteedastusvõimalusi kui USB 3.1 Gen 1. Kui teil on vaja ühendada kiireid väliseid salvestusseadmeid, suure jõudlusega riistvara või suure võimsusega seadmeid, oleks see parem sobiv valida USB 3.1 Gen 2 liides. Kui aga teie seadmed on peamiselt USB 2.{13}} ajastu tooted, võib USB 3.1 Gen 1 olla praktilisem valik.